刘铭传这里进攻长兴，遇上了萧有和，第一天的攻击就以损伤800人，而潦草收场，他希望左宗棠在湖州以东的行动快一点，希望前后夹击萧有和。
而左宗棠这里已经通过俘虏，了解到幼天王洪天贵福就藏身在湖州。于是，他制定了“先剪枝叶、再拔根本” 的战术思想，安排了三路大军进攻湖州外围据点，决心毕其功于一役。擒获幼天王洪天贵福这个功劳自不必多说；湖州这里战略地位的重要性也是一个因素；政治军事竞争的需要也是左宗棠需要考虑的重要原因；还有就是通过军事胜利巩固对浙江的控制权。湖州的陷落标志着浙江全境太平军势力的肃清，为其后续治理东南、推行洋务政策奠定基础。
历史上，左宗棠三路围攻的安排如下：南路主攻，他安排高连升率领楚军主力从德清出发，目标直指湖州第一道防线的菱湖、东林。此路旨在突破太平军外围据点，打开湖州南门的屏障。是南路的主攻力量。
东路佯攻：刘树元与降将蔡元吉统带楚军及部分淮军，从桐乡、乌镇方向逼近，牵制太平军注意力于湖州东郊。蔡元吉部作战勇猛，曾一度突破荻港防线，但遭黄文金反击受挫。
西路截援：左宗棠特别注重切断太平军与皖南的联系，派军监视长兴、安吉一线，试图阻断皖浙交通线。后因兵力不足，联合淮军郭松林部猛攻长兴，最终由淮军攻破长兴，彻底孤立湖州。
不过由于箫有和这个变数的出现，这个时候，左宗棠可以用来围攻湖州的清军人数，洋人军队的人数都较之前有了变化，如历史上郭松林、刘士奇、王永胜、杨鼎勋等率30营淮军进攻长兴如今变成了刘铭传一部。因此他的三路围攻也做了调整。为了确保策略成功，他特意向朝廷上了请求派兵助剿的折子。
为了贯彻军议上“东守西攻，攻淮守楚”的决定，黄文金只能率领城中太平军借助城墙进行死守，凭借其经验，多次击退了清军的进攻，当然，清军也有取得一些进展。
9月18日，黄文金在荻港、袁家汇击败当时正在进攻太平军后路的浙江布政使蒋益澄；9月19日，清军高连升等营攻陷荻港太平军营垒3座；9月21日，太平军夺取“常捷军”火炮一门；9月24日，蒋益澄分兵三路再次进攻袁家汇又被太平军击退。
左宗棠立于阵前，远远望着湖州城头飘扬的太平军旗帜，指节捏得发白。九月的秋风卷着血腥气掠过他的胡须，在他的脚边打了个旋，帐下亲兵呈上最新战报时，他的目光死死钉在 \"幼天王藏于湖州\" 六个字上。这个消息像烧红的烙铁烫穿他的胸腔 —— 自安庆会战起，湘军与太平军缠斗十载，若能在此役擒获太平天国最后的象征，定能彻底瓦解江浙余孽。他这样想着这件事的可能。望着东南方渐起的火光，耳边回荡着刘铭传昨夜的急报：\"长兴南门折损八百，萧有和这厮竟用西洋开花弹！\" 他想起折子中 \"霆军精锐五千\" 的字样，忽然觉得这墨迹像极了将士们凝固的血。彭雪麟的水师此刻该已封锁太湖，可霆军前锋还在平望耽搁 —— 这是曾国藩的制衡之术？还是李鸿章在背后掣肘？
\"传令三路总兵，明日卯时务必拿下袁家汇！\" 他猛然转身，甲胄铿锵作响，\"告诉蒋益澄，若再让黄文金从荻港突围，提头来见！\" 帐外灯笼在风中摇晃，将他的影子投在军图上，仿佛一柄悬在湖州城上的利剑。
二十里外的淮军营寨里，淮军统领望着被太平军炮火轰塌的辕门，狠狠啐了口血沫。这些安徽子弟兵本以为跟着湘军能捡现成功劳，孰料黄文金的守军竟比李秀成的嫡系还难缠。\"湘军吃肉，咱们连汤都喝不上！\" 副将擦拭着新缴获的 \"大将军\" 火炮，炮管上还沾着法国炮手的脑浆，\"不如今夜劫营，活捉幼天王立首功！\"为了夺取太平军这个长兴城外的据点，他手下的十余名士兵丢掉了性命。他朝地上那个脑浆迸裂的洋人吐了一口痰。
刘铭传盯着营外忽明忽暗的烽火，想起三天前潘鼎新部淮军抢攻荻港时，湘军故意放慢左翼推进速度。此刻他握着重赏购来的湖州布防图，指腹在 \"黄文金\" 三个字上反复摩挲。若能在湘军前撕开缺口，既能夺取那传说中的圣库，又能让李鸿章大人在朝廷面前挣个先手 —— 这其中的轻重他刘铭传拎得清。他决定发动一次夜袭。
城头上，黄文金望着清军大营如蚁群般蠕动的火把，突然剧烈咳嗽起来。亲兵要扶他下城，却被他推开：\"把药酒拿来！\" 老将军扯开衣襟，露出遍布胸腹的弹片伤痕，这些新旧伤口在药酒刺激下泛起诡异的潮红。他仰头饮尽最后半坛酒，将空坛砸向城下：\"告诉弟兄们，湘军的火药味越浓，说明他们的粮道越近！\"他的豪言也激起了城头上太平军的斗志。此时，幼天王洪天贵福也来到了城头上，他轻轻为老将军黄文金拉上披开的衣襟道：“老将军威武，夜晚风大，可不敢损伤了将军。”黄文金见是幼天王，赶忙抱拳施礼：“口称不敢。”黄望着少年单薄的身影，喉头突然涌上腥甜。他单膝跪地，声音铿锵：\"请幼主速离城头！\" 洪天贵福环视了一圈，点头朝黄文金道：“如此，要辛苦老将军了。”这城头上君臣相得的一幕深深打动了看到的人。
子时的梆子声刚过，袁家汇方向突然传来闷雷般的马蹄声。左宗棠猛然掀开帐帘，只见东南方火光冲天，隐约听见 \"活捉黄文金\" 的呐喊。他瞳孔骤缩 —— 那分明是淮军的旗号！他们这是要夜战吗？
左宗棠想起自己上的那份奏折。
奏为湖州逆酋负隅，恳请饬调援军协剿事
同治五年九月二十七日
兵部侍郎兼署闽浙总督臣左宗棠跪奏：
窃臣自入浙以来，督军进剿湖州踞匪。近据探报，伪幼天王洪天贵福确在城中，黄文金纠集死党万余，恃城固守。臣已饬令高连升、蒋益澄等部水陆并进，期于中秋前合围。
惟逆贼凶悍异常，九月十八日，蒋益澄部攻荻港后路，遇伏失利；十九日虽克敌垒三座，旋被逆酋率死士夺回火炮两门；廿四日袁家汇再战，我军伤亡逾千，仍未得手。目下贼众凭险顽抗，常胜军炮火亦多损毁，粮道时有梗阻。
更可虑者，虽有淮军协剿，然各军协同未畅。廿一日，高连升部轻骑突进东门，致折损精锐三百余人。臣已严饬各营归建协防，仍需时日整肃。
湖州为东南锁钥，若久攻不下，恐贼酋乘隙逃窜。恳请皇上饬令彭雪麟水师速赴太湖，断贼粮道；另调霆军精锐五千，由平望方向驰援。臣当亲率楚军主力，于廿八日水陆夹攻，务期擒获首逆，克复坚城。
谨附战损清单及湖州城防图各一，伏乞皇上圣鉴。
左宗棠 谨奏
（折尾附：九月十八至廿四日战损清单、湖州城防图、幼天王藏匿处所密报）
左宗棠的手指划过奏折中 \"彭雪麟水师\" 的字样，帐外突然传来加急马蹄声。\"报 —— 彭军门水师已抵太湖口！\" 亲兵话音未落，又一骑飞驰而至：\"霆军前锋已抵达平望！\"“蔡元吉部已到海宁” 又一骑飞驰急报。
老帅布满血丝的眼睛陡然迸出精光。他抓起案头狼毫，在 \"廿八日总攻\" 旁重重圈画，墨迹透纸欲滴。帐外火把将他的剪影投在城防图上，仿佛一只巨鹰正收拢羽翼，准备扑向困兽。
与此同时，淮军大营的火把突然齐刷刷转向东门。刘铭传将染血的布防图揣入怀中，翻身上马时皮靴踩碎了半块太平军令牌：\"告诉弟兄们，湘军要摘桃子，咱们偏要抢在他们前头！\" 副将欲言又止，却见他抽出李鸿章手书：\"若能生擒幼逆，赏银十万两！\"
湖州城头，黄文金的望远镜里映出清军水师桅杆如林。他扯下脖颈上的红绸带抛向火海，那是当年金田起义时洪秀全所赐。\"开炮！\" 老将的吼声混着药酒味，太平军的土炮与 \"常捷军\" 火炮同时轰鸣，炸碎了清军水师刚架起的浮桥。
卯时的晨雾中，左宗棠按剑立于阵前。当彭雪麟的水师突破封锁线时，他猛然抽出尚方宝剑：\"传我将令 —— 攻入东门者，赏穿黄马褂！\" 刹那间，湘军如决堤洪水般冲向城墙，云梯与滚石在晨雾中交织成血色罗网。